Ajakirjas Gut ilmunud uurimus hõlmas 100 Covid-19 tõttu haiglaravi vajanud patsienti. Kontrollrühma moodustasid 78 tervet täiskasvanut, kes osalesid mikrobioomiuuringus juba enne pandeemiat. Covid-19 patsientide seedetrakti bakteriaalne kooslus erines statistiliselt oluliselt kontrollrühmast vaatamata sellele, kas viimaseid oli ravitud ka antibiootikumidega või mitte.
Mitmed seedetrakti immuunsüsteemi mõjutava potentsiaaliga bakterid nagu Faecalibacterium prausnitzii, Eubacterium rectale ja bifidobakterid olid Covid-19 haigete mikrobioomis alaesindatud ja jäid vähesteks ka proovides, mis olid võetud 30 päeva pärast paranemist. Bakteriaalse koostise muutuste ulatus oli Covid-19 haigeil vastavuses haiguse raskusega ning korrelatsioonis mitmete põletikuliste tsütokiinide ja kemokiinide ning koekahjustuse näitudega. Probiootikumid võivad Covid-19 puhul olla organismis tasakaalu taastamiseks potentsiaalselt kasulikud.