AVASTUS ⟩ Kõhubakterid on olulisel määral päritavad
11. juuli 2021, 13:34
Meie soolestiku mikrobioomi – pidevalt muutuvat soolestikus elavate bakterite «vihmametsa» – mõjutab peamiselt elustiil, sealhulgas see, mida sööme, või ravimid, mida võtame, näitab enamik uuringuid. Notre Dame'i ülikooli uuringus leiti aga, et soolebakterite kooslust mõjutab geneetika rohkem, kui seni on arvatud.
Hiljuti ajakirjas Science avaldatud uuringus avastasid teadlased, et enamik soolestiku mikrobioomis olevaid baktereid on pärilikud. Nad vaatasid läbi rohkem kui 16 000 soolestiku mikrobioomi profiili, mis oli kogutud 14 aasta jooksul Keenia Amboseli rahvuspargi paavianite populatsioonilt. Kuid profiil muutub ajas, aastaaegade kaupa ja vanusega. Meeskond leidis ka, et mitmed paavianite pärilikud mikrobioomi tunnused on päritavad ka inimestel.
«Keskkond mängib mikrobioomi kujundamisel suuremat rolli kui geenid, kuid see uuring viib meid eemale ideest, et geenid mängivad mikrobioomis väga vähe rolli,» ütles bioloogiateaduste osakonna professor ja uuringu juhtivteadur Elizabeth Archie Medical Xpressis.
Soolestiku mikrobioom täidab mitut ülesannet. Lisaks toidu seedimisele aitab see luua olulisi vitamiine ja aitab kaasa immuunsüsteemi treenimisele. Uus uurimus on esimene, mis näitab olulist seost pärilikkusega.
Varasemad uuringud inimeste soolestiku mikrobioomi kohta näitasid, et ainult 5–13 protsenti mikroobidest olid pärilikud, kuid Archie ja uurimisrühm oletasid, et madal arv tuleneb soolestiku mikrobioomi «hetktõmmise» uurimisest.
Oma uuringus kasutasid teadlased fekaaliproove 585 metsikult Amboseli paavianilt – tavaliselt koguti ühelt loomalt rohkem kui 20 proovi. Proovide mikrobioomiprofiilid näitasid paavianide dieedi varieerumist märjal ja kuival aastaajal. Kogutud andmed sisaldasid üksikasjalikku teavet peremeesorganismi kohta, sealhulgas teadaolevate järeltulijate, keskkonnatingimuste, sotsiaalse käitumise, ja toitumise kohta kogumise ajal.
Uurimisrühm leidis, et 97 protsenti mikrobioomi omadustest, sealhulgas üldine mitmekesisus ja üksikute mikroobide arvukus, olid märkimisväärselt pärilikud. Pärilikkuse protsent näib aga palju madalam – kuni viis protsenti – kui proove testitakse ainult ühel ajahetkel, nagu seda tehakse inimeste puhul. See rõhutab sama isiku proovide uurimise olulisust aja jooksul.
«See viitab tõesti sellele, et osa põhjusest, miks teadlased pole leidnud pärilikkust inimeste puhul, on see, et neil pole sügavkülmas kümne aasta jagu fekaaliproove,» ütles Archie.
Meeskond leidis tõendeid selle kohta, et keskkonnategurid mõjutavad soole mikrobioomi pärilikkust. Mikrobioomi pärilikkus oli kuival aastaajal tavaliselt 48 protsenti suurem kui niiskel, mis võib olla seletatav paavianite mitmekesisema toitumisega vihmaperioodil. Uuringu kohaselt suurenes pärilikkus ka vanusega.
Kuna uuring näitas ka keskkonna olulist mõju paavianide soolestiku mikrobioomidele, nõustusid teadlased varasemate uuringutega, kus on tuvastatud, et keskkonnamõjud soolestiku mikrobioomi varieerumisele mängivad suuremat rolli kui geneetika.
Kuid teadmine, et soolestiku mikrobioom on päritav, võiks aidata tulevikus ravimeetodeid kohandada, lähtudes selle geneetilisest koostisest.